2014年11月1日，由復旦大學醫院管理研究所推出的《2013年度中國最佳醫院綜合排行榜》發布。北京協和醫院、四川大學華西醫院和中國人民解放軍總醫院繼續雄踞榜單前三甲。
下面是詳細榜單：
北京協和醫院、四川大學華西醫院和中國人民解放軍總醫院繼續雄踞榜單前三甲。
2013年度中國最佳醫院綜合排行榜（綜合）
| 排名 | 醫院名字 | 聲譽權重 | 科研權重 | 總得分 |
| 1 | 北京協和醫院 | 80 | 11.368 | 91.368 |
| 2 | 四川大學華西醫院 | 69.268 | 20 | 89.268 |
| 3 | 中國人民解放軍總醫院 | 64.214 | 15.651 | 79.865 |
| 4 | 上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院 | 39.895 | 16.863 | 56.758 |
| 5 | 第四軍醫大學西京醫院 | 39.128 | 14.436 | 53.564 |
| 6 | 復旦大學附屬華山醫院 | 37.665 | 11.035 | 48.7 |
| 7 | 復旦大學附屬中山醫院 | 31.719 | 13.548 | 45.267 |
| 8 | 華中科技大學同濟醫學院附屬同濟醫院 | 30.438 | 12.21 | 42.648 |
| 9 | 中山大學附屬第一醫院 | 29.576 | 12.5 | 42.076 |
| 10 | 北京大學第一醫院 | 31.776 | 9.192 | 40.968 |
| 11 | 北京大學人民醫院 | 29.133 | 9.678 | 38.811 |
| 12 | 北京大學第三醫院 | 19.304 | 8.827 | 28.131 |
| 13 | 浙江大學醫學院附屬第一醫院 | 14.518 | 13.525 | 28.043 |
| 14 | 中國醫科大學附屬第一醫院 | 14.446 | 13.013 | 27.459 |
| 15 | 中南大學湘雅二醫院 | 15.995 | 11.383 | 27.378 |
| 16 | 南方醫科大學南方醫院 | 16.082 | 10.226 | 26.308 |
| 17 | 上海交通大學醫學院附屬仁濟醫院 | 14.325 | 11.972 | 26.297 |
| 18 | 第二軍醫大學長海醫院 | 14.732 | 11.422 | 26.154 |
| 19 | 華中科技大學同濟醫學院附屬協和醫院 | 14.613 | 10.288 | 24.901 |
| 20 | 復旦大學附屬腫瘤醫院 | 11.592 | 10.799 | 22.391 |
| 21 | 上海交通大學醫學院附屬第九人民醫院 | 11.265 | 11.12 | 22.385 |
| 22 | 中南大學湘雅醫院 | 12.068 | 10.032 | 22.1 |
| 23 | 中國醫學科學院腫瘤醫院 | 13.079 | 8.997 | 22.076 |
| 24 | 山東大學齊魯醫院 | 9.208 | 12.679 | 21.887 |
| 25 | 中國醫學科學院阜外心血管病醫院 | 12.187 | 9.147 | 21.334 |
| 26 | 江蘇省人民醫院 | 8.526 | 12.431 | 20.957 |
| 27 | 首都醫科大學附屬北京安貞醫院 | 9.532 | 10.892 | 20.424 |
| 28 | 中國醫科大學附屬盛京醫院 | 10.733 | 9.52 | 20.253 |
| 29 | 南京軍區南京總醫院 | 8.676 | 11.148 | 19.824 |
| 30 | 中山大學腫瘤防治中心 | 6.241 | 13.445 | 19.686 |
| 31 | 上海交通大學醫學院附屬新華醫院 | 8.055 | 10.971 | 19.026 |
| 32 | 第三軍醫大學西南醫院 | 8.667 | 10.354 | 19.021 |
| 33 | 第二軍醫大學長征醫院 | 8.2 | 10.8 | 19 |
| 34 | 首都醫科大學附屬北京天壇醫院 | 10.076 | 8.912 | 18.988 |
| 35 | 首都醫科大學宣武醫院 | 10.998 | 7.468 | 18.466 |
| 36 | 上海市第六人民醫院 | 6.598 | 11.543 | 18.141 |
| 37 | 廣東省人民醫院 | 12.841 | 5.251 | 18.092 |
| 38 | 首都醫科大學附屬北京同仁醫院 | 10.106 | 7.766 | 17.872 |
| 39 | 復旦大學附屬眼耳鼻喉科醫院 | 10.403 | 7.034 | 17.437 |
| 40 | 復旦大學附屬兒科醫院 | 10.998 | 5.755 | 16.753 |
| 41 | 浙江大學醫學院附屬第二醫院 | 4.805 | 11.764 | 16.569 |
| 42 | 首都醫科大學附屬北京兒童醫院 | 10.998 | 4.852 | 15.85 |
| 43 | 廣州醫科大學附屬第一醫院 | 8.619 | 6.459 | 15.078 |
| 44 | 中山大學孫逸仙紀念醫院 | 6.113 | 8.366 | 14.479 |
| 45 | 南京大學醫學院附屬鼓樓醫院 | 4.445 | 9.836 | 14.281 |
| 46 | 天津醫科大學附屬腫瘤醫院 | 5.349 | 8.724 | 14.073 |
| 47 | 中山大學中山眼科中心 | 5.944 | 7.946 | 13.89 |
| 48 | 天津醫科大學總醫院 | 5.611 | 8.023 | 13.634 |
| 49 | 中山大學附屬第三醫院 | 5.022 | 8.127 | 13.149 |
| 50 | 蘇州大學附屬第一醫院 | 3.887 | 9.149 | 13.036 |
| 51 | 哈爾濱醫科大學附屬第一醫院 | 4.74 | 7.999 | 12.739 |
| 52 | 上海交通大學醫學院附屬上海兒童醫學中心 | 8.322 | 4.337 | 12.659 |
| 53 | 北京大學口腔醫院 | 5.944 | 6.646 | 12.59 |
| 54 | 四川大學華西口腔醫院 | 5.052 | 7.423 | 12.475 |
| 55 | 武漢大學人民醫院 | 2.388 | 10.062 | 12.45 |
| 56 | 北京醫院 | 6.449 | 5.422 | 11.871 |
| 57 | 重慶醫科大學附屬兒童醫院 | 7.133 | 4.599 | 11.732 |
| 58 | 四川大學華西第二醫院 | 5.052 | 6.653 | 11.705 |
| 59 | 吉林大學第一醫院 | 2.941 | 8.743 | 11.684 |
| 60 | 山東省立醫院 | 3.001 | 8.648 | 11.649 |
| 61 | 第四軍醫大學唐都醫院 | 3.922 | 7.522 | 11.444 |
| 62 | 首都醫科大學附屬北京朝陽醫院 | 2.682 | 8.52 | 11.202 |
| 63 | 第四軍醫大學口腔醫院 | 3.863 | 7.095 | 10.958 |
| 64 | 上海市胸科醫院 | 5.061 | 5.892 | 10.953 |
| 65 | 復旦大學附屬婦產科醫院 | 5.052 | 5.873 | 10.925 |
| 66 | 中國醫學科學院血液學研究所 | 5.944 | 4.959 | 10.903 |
| 67 | 重慶醫科大學附屬第一醫院 | 0.967 | 9.737 | 10.704 |
| 68 | 北京大學腫瘤醫院 | 3.536 | 7.162 | 10.698 |
| 69 | 浙江大學醫學院附屬兒童醫院 | 5.944 | 4.697 | 10.641 |
| 70 | 上海交通大學醫學院附屬第一人民醫院 | 1.901 | 8.724 | 10.625 |
| 71 | 西安交通大學醫學院第一附屬醫院 | 0.524 | 9.949 | 10.473 |
| 72 | 第三軍醫大學新橋醫院 | 2.998 | 7.396 | 10.394 |
| 73 | 同濟大學附屬上海市肺科醫院 | 4.46 | 5.905 | 10.365 |
| 74 | 上海市精神衛生中心 | 5.052 | 5.281 | 10.333 |
| 75 | 中國醫學科學院整形外科醫院 | 5.052 | 5.116 | 10.168 |
| 76 | 安徽醫科大學第一附屬醫院 | 2.688 | 7.469 | 10.157 |
| 77 | 北京積水潭醫院 | 5.944 | 4.129 | 10.073 |
| 78 | 山東省腫瘤醫院 | 2.674 | 7.382 | 10.056 |
| 79 | 沈陽軍區總醫院 | 2.977 | 6.783 | 9.76 |
| 80 | 北京大學第六醫院 | 5.944 | 3.592 | 9.536 |
| 81 | 中日友好醫院 | 5.617 | 3.896 | 9.513 |
| 82 | 哈爾濱醫科大學附屬第二醫院 | 1.841 | 7.47 | 9.311 |
| 83 | 東方肝膽外科醫院 | 0.741 | 8.179 | 8.92 |
| 84 | 上海市兒童醫院 | 1.187 | 7.706 | 8.893 |
| 85 | 鄭州大學第一附屬醫院 | 1.159 | 7.71 | 8.869 |
| 86 | 中國醫學科學院皮膚病醫院(研究所) | 4.457 | 4.353 | 8.81 |
| 87 | 首都兒科研究所 | 3.863 | 4.904 | 8.767 |
| 88 | 重慶醫科大學附屬第二醫院 | 0.593 | 7.902 | 8.495 |
| 89 | 武漢大學口腔醫院 | 3.268 | 5.093 | 8.361 |
| 90 | 首都醫科大學附屬北京地壇醫院 | 4.457 | 3.838 | 8.295 |
| 91 | 復旦大學附屬華東醫院 | 4.457 | 3.756 | 8.213 |
| 92 | 浙江大學醫學院附屬婦產科醫院 | 3.863 | 4.328 | 8.191 |
| 93 | 首都醫科大學附屬北京友誼醫院 | 2.763 | 5.413 | 8.176 |
| 94 | 西安交通大學醫學院第二附屬醫院 | 1.119 | 6.767 | 7.886 |
| 95 | 中國人民解放軍第三零二醫院 | 2.674 | 4.656 | 7.33 |
| 96 | 浙江省腫瘤醫院 | 2.376 | 4.674 | 7.05 |
| 97 | 廣州市婦女兒童醫療中心 | 3.863 | 3.104 | 6.967 |
| 98 | 天津醫科大學第二醫院 | 1.484 | 5.462 | 6.946 |
| 99 | 哈爾濱醫科大學附屬腫瘤醫院 | 1.484 | 5.411 | 6.895 |
| 100 | 南京醫科大學附屬南京第一醫院 | 0.286 | 6.48 | 6.766 |