Microsoft 一直致力于提高互操作性，已發布了新的 Java 數據庫連接 (JDBC) 驅動程序。所有 SQL Server 用戶都可以免費下載 SQL Server JDBC Driver 2.0，并可以從任何 Java 應用程序、應用程序服務器或支持 Java 的小程序訪問 SQL Server 2000、SQL Server 2005 和 SQL Server 2008。這是一個 Type 4 JDBC 驅動程序，它通過 Java Platform, Enterprise Edition 5 中可用的標準 JDBC 應用程序編程接口 (API) 提供數據庫連接。
此版本的 JDBC 驅動程序與 JDBC 4.0 兼容，并在 Java 開發工具包 (JDK) 5.0 版或更高版本上運行。它已針對所有主要應用程序服務器（包括 BEA WebLogic、IBM WebSphere 和 JBoss）進行了測試。