一 軟件功能介紹
Trojan Remover6.3.1就是一個專門用來清除特洛伊木馬和自動修復系統文件的工具，它能夠檢查系統登錄文件、掃描Win.ini、System.ini和系統登錄文件，且掃描完成后會產生Log信息文件，并幫我們自動清除電腦中的特洛伊木馬和修復系統文件。
二 更新數據庫代碼
由于木馬病毒泛濫，因此軟件需要升級病毒數據庫，Trojan Remover可支持在線木馬數據庫的更新，在主界面中點“Update”按鈕進入更新界面，在這里選擇下載的服務器類別比如Server3，然后點“Update”按鈕進行數據庫下載更新，如果出現出錯提示無法下載的話，換一個服務器類別試一下，也可以到http://www.simplysup.com/download/trj631.exe下載最新數據庫手動安裝更新。
三 掃描并修復系統文件
在軟件主界面中，進入“File”菜單下的“Scan for Active Malware”選項或直接點界面中的“Scan”按鈕（如圖1），接著會對系統的各種錯誤文件進行掃描并自動修復（這里的系統文件指的是注冊表、Win.ini、System.ini等之類文件），在掃描過程中，如果發現系統文件有錯誤或被病毒感染，會自動對其進行修復，并且此時會跳出一個界面提示你做出選擇，一般默認點“OK”按鈕即可。全部掃描結束后出現一個結束界面，如果你點“View Log” 按鈕，就可以查看到所有掃描的詳細記錄過程。
圖1 檢測系統中的木馬
如果你希望開機時自動掃描包括系統登錄文件、Win.ini、System.ini和注冊表項目在內的系統文件，并幫你自動清除特洛伊木馬和修復系統文件，只要在軟件主界面中選擇“Options→Enabled Boot-time scanning”選項即可。
四 掃描并清除木馬
在軟件主界面中，進入“File→Scan A Drive or Directory” 選項，在進行木馬掃描檢測之前，需要設置掃描的文件類型，點“Options→Files to Scan” 選項打開文件掃描參數設置對話框，在上面自定義需要掃描的文件類型，切記“SCR、SWF、VBS、SYS、VXD、JES、JS”等幾個文件類型一定要選中，筆者這里建議全部選中，設置好后點“Save”按鈕保存。
返回“Scan A Drive or Directory”主界面，選擇需要掃描的硬盤分區或文件目錄，同時點選“Include Subdirectories”以加快掃描速度，最后點“Start Scan” 按鈕開始進行掃描（如圖2）。當掃描到木馬時，會彈出警告窗口顯示木馬的名稱與位置，并刪除相關的設置更改木馬程序的名稱，以阻止木馬重新啟動。若是遇到常駐在內存的木馬時，系統會重新啟動機器，停止木馬執行并保護系統，使用者不需進入安全模式甚至DOS模式下就能清除木馬。
圖2 對系統進行掃描